Figlio di un Anastasio, nobile romano, fu eletto papa dopo la morte di Pelagio I. Durante il suo pontificato, i re longobardi s'impadronirono dell'Italia, eccentuato l'esarcato di Ravenna. I pontefici erano sottoposti all'esarca. Giovanni I confermò il quinto concilio generale; consacrò la basilica di Santi XII Apostoli che decorò di mosaici e di dipinti. Si hanno di lui due lettere nella Collectio conciliarum, ma si vuole siano apocrife. Morì il 13 luglio 573