L'imperatore Ottone III, avuta notizia della morte di Giovanni XV fece eleggere papa Brunone, suo nipote o cugino, che allora aveva soltanto ventiquattro anni, e che assunse il nome di Gregorio V. Ma nell'anno 997, mentre l'imperatore era nel nord dell'Europa, il patrizio Crescenzio, prese il titolo di console, rinnovò le sue imprese d'un tempo, ben sapendo come i romani fossero ostili alla dominazione tedesca. Egli esiliò da Roma Gregorio, e fece eleggere l'antipapa Filagate, che si chiamò Giovanni XVI. Il papa, adunato un concilio in Pavia, scomunicò Crescenzio e l'antipapa, e Ottone III, sceso in Italia con un esercito, lo accompagnò a Roma. Crescenzio si chiude in Castel Sant'Angelo, e l'antipapa, preso mentre fuggiva, fu mutilato del naso e della lingua e poi accecato. Frattanto il console, costretto ad arrrendersi, venne ucciso, quantunque il papa gli avesse promesso di lasciargli la vita.