Alla morte di S. Agatone, nel 682, fu eletto papa Leone II, siciliano di nascita. Questo pontefice confermò gli atti del terzo concilio ecumenico di Costantinopoli, tenuto nel 680, e mandò all'imperatore Costantino III una lettera dogmatica diretta contro i Monoteliti. Richiestone dall'imperatore, mandò a Costantinopoli un suo rappresentante munito di speciali poteri. Tali poteri si riducevano a udire le proposte, comunicarle al papa e aspettare la sua risposta per votare definitivamente nel consiglio. In tal modo, Leone cercò di preservare la supremazia papale contro i continui sforzi che facevano i patriarchi di Costantinopoli per liberarsi dalla dipendenza da Roma. Durante il suo brevissimo pontificato, questo papa fece iniziare in Roma i lavori di una chiesa in onore di S. Paolo, e vi fece deporre i corpi dei martiri Simplicio e Faustino. Inoltre, istituì il bacio di pace nella messa e l'aspersione dell'acqua benedetta sul popolo. Morì nel 683.